Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP5P51878 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP5P51878 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP5P51878 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms