Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms