Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP4P49662 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP4P49662 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP4P49662 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP4P49662 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP4P49662 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP4P49662 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP4P49662 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP4P49662 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP4P49662 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP4P49662 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms