Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPFP49454 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPFP49454 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPFP49454 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPFP49454 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPFP49454 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPFP49454 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms