Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK8P49336 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK8P49336 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDK8P49336 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK8P49336 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms