Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4P46934 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms