Protein–RNA interactions for Protein: P46777

RPL5, 60S ribosomal protein L5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P46777 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL5P46777 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL5P46777 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms