Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNNT2P45379 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms