Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMPOP42166 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMPOP42166 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMPOP42166 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMPOP42166 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMPOP42166 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms