Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC1P33527 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms