Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX2P32243 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
OTX2P32243 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX2P32243 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX2P32243 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX2P32243 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms