Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA13P31271 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms