Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PPIFP30405 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms