Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCKSP29966 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCKSP29966 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms