Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD1P29536 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms