Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD1BP29016 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD1BP29016 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD1BP29016 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD1BP29016 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD1BP29016 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD1BP29016 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD1BP29016 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD1BP29016 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD1BP29016 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms