Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB9P28065 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMB9P28065 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms