Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSSP25774 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTSSP25774 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTSSP25774 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms