Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRBP23467 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms