Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5AP20339 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5AP20339 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms