Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGCP20142 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGCP20142 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGCP20142 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGCP20142 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGCP20142 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms