Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B1P20020 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms