Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNNI3P19429 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms