Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATF3P18847 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF3P18847 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF3P18847 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF3P18847 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATF3P18847 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF3P18847 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF3P18847 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF3P18847 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF3P18847 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms