Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA6P17658 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA6P17658 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNA6P17658 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms