Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms