Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB4P16144 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms