Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNT1P13805 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNT1P13805 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms