Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA4P13612 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA4P13612 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms