Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BMP3P12645 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMP3P12645 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms