Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2AF1L5P0DN76 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2AF1L5P0DN76 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms