Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf88P0DMB2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C8orf88P0DMB2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms