Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00869P0C866 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00869P0C866 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms