Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB7P09629 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB7P09629 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms