Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP10P09238 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP10P09238 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP10P09238 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP10P09238 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms