Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRCP08575 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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