Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSN3P07498 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSN3P07498 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSN3P07498 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms