Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFNA4P05014 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFNA4P05014 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms