Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DQB1P01920 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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