Protein–RNA interactions for Protein: O95167

NDUFA3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA3O95167 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFA3O95167 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms