Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ECM2O94769 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms