Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JRKO75564 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JRKO75564 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JRKO75564 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JRKO75564 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JRKO75564 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JRKO75564 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JRKO75564 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JRKO75564 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JRKO75564 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JRKO75564 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JRKO75564 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
JRKO75564 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
JRKO75564 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
JRKO75564 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
JRKO75564 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JRKO75564 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms