Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms