Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM4AO75164 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms