Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGSF3O75054 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms