Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB3O43889 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms