Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LANCL1O43813 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms