Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms