Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms