Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FANCAO15360 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FANCAO15360 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FANCAO15360 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FANCAO15360 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FANCAO15360 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FANCAO15360 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCAO15360 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCAO15360 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FANCAO15360 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FANCAO15360 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FANCAO15360 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms